1951届校友、中国科学院院士、国际著名医学病毒专家、甲肝疫苗发明者毛江森荣获2007年度浙江省科学技术重大贡献奖，浙江省人民政府奖励毛江森院士个人人民币50万元，以表彰他从事病毒学研究50年来在病毒学研究领域所取得的成绩和对病毒性疾病预防控制，尤其在甲型肝炎流行控制方面所作出的突出贡献。毛江森校友饮水思源，和夫人商量决定，把所获得的50万元奖金全部捐赠给母校杭高，设立“杭州高级中学毛江森院士奖教基金”，以奖励在教学一线教书育人、爱护学生、为人师表、师德高尚、深受学生爱戴、为全校师生所公认的好老师。如今已颁发6届。

第一届（2010年）获奖人员

王红健、许钢、陆乃钏、林岚、赵种霞、缪水娟。

第二届（2012年）获奖人员

朱海其、陈明华、周顺钿、周伟

第三届（2013年）获奖人员

伊建军、许涛、余知辛、倪正元

第四届（2010年）获奖人员

包素茵、王建勋、李刚、施皪

第五、六届（2017年）获奖人员

陈伟浓、朱俊勤、王珺、孙俊、施皪、包情伟、费红亮、高利